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La svolta della biotecnologia PDF Stampa
Scritto da minopausa   
martedì 12 febbraio 2008
Ultimo aggiornamento ( mercoledì 13 febbraio 2008 )
 

http://www.scionics.de/

img http://www.scionics.de/

Coloro che combattono ogni giorno con proteine in 3D, analisi dei geni (o del genoma?), rappresentazioni dell'RNA, del DNA e chi più ne ha più ne metta, la soluzione è pressocchè univoca: software vecchissimi (software che spesso risalgono al 1997) che girano su piattaforme Windows. La cosa drammatica è che questi software costano centinaia di euro, se non migliaia (parliamo per esperienza). Ci rivolgiamo ai biotecnologi e ai bioinformatici che necessitano di una svolta nella loro qualità del lavoro, usando strumenti più innovativi, recenti e raffinati. Forse la possibilità di questa svolta concreta e opensource esiste già e si chiama bioinformatics.org! Di seguito vi elenchiamo un po' di informazioni!

Bioinformatics.org ci ha colpito molto per l'eccellente quantità e qualità delle news postate costantemente dagli utenti che partecipano a questo progetto e che riguardano la bioinformatica... roba forte che ci fa restare a bocca aperta! Il punto di forza è la sezione All software projects: una vera e propria cornucopia di progetti software open source scaricabili gratuitamente e disponibili sia per Linux (da riga di comando o con GUI), sia per Windows, sia per Mac e anche per siti web! Alcuni progetti di punta sono: set di applicazioni web per l'analisi del genoma, gestori ed editor per le sequenze di aminoacidi/proteine/xNA, applicazioni java-based  per l'analisi dei dati genetici, etc. La cosa formidabile è la possibilità di scaricare (tenetevi forte) una distribuzione Linux chiamata Bio-Linux: un vero e proprio centro bioinformatico basato su Debian GNU/Linux, pieno zeppo di applicazioni e tool per la biotecnologia (ma non solo). Ci chiediamo cosa aspettano gli interessati a buttarsi a capofitto nel sito e collaborare!
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Commenti utenti (4)
Postato da Antonio Cavallo, il 13-02-2008 15:57,
1. Chi paga?
Di software "libero" (= gratis) ce n'e' tanto in bioinformatica. Il problema e': chi lo paga? 
Il fatto che i software siano vecchissimi dimostra che nessuno ha voglia di sostenere i costi di 
sviluppo: ossia che non c'e' un grande interesse.
 
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Postato da minopausa, il 13-02-2008 17:49,
2. boH!
Non riesco a comprendere a pieno l'asserzione di Antonio Cavallo ma proverò a rispondere ugualmente. Parlando per esperienza, non per teoremi, assicuro Cavallo che gli enti ospedalieri/laboratori privati/centri di ricerca/università comprano software e lo usano per anni fino a quando non diventa "vecchio" e continuano ad usarlo perchè aggiornarlo o comprarne altro significherebbe sborsare otto o novemila euro nella migliore delle ipotesi. Ora: se il software è gratis... non lo paga nessuno. Se i progetti nel campo ci sono... significa che l'interesse c'è. Se gli enti vogliono pagare l'ira di Iddio per comprare un software... farebbero meglio a pagare un programmatore o un'equipe che lo sviluppi (tanto con quello che costa il sw a pagamento è meglio mantenere 5 programmatori&famiglie stipendiati per 6 mesi). Mi pare ovvio che qui il problema sono gli enti che comprano e non finanziano lo sviluppo che dovrebbe interessare in primis a loro.
 
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Postato da gruthelsud, il 14-02-2008 19:22,
3. costruisciti...
Stanco dei vecchi programmi per sequenziare il genoma? 
Stanco dei soliti coronavirus precotti? 
Stanco di essere l'unico dei tuoi amici a non aver ancora inventato un vaccino per la febbre marrone? 
Da oggi in edicola c'è : costruisciti il tuo software bioinformatico, con sole 199 uscite mensili potrai ottenere competenze scientifiche e tutto l'occorrente per codificare le proteine tue e dei tuoi amici. 
Mai più acidi deossiribonucleici fatti con colla e coriandoli, mai più legami idrogeno fatti con gli stecchini. 
con costruisciti il tuo softwer bioinformatico non avri più bisogno di pagare costosi ingegneri informatici. 
cosa aspetti? corri in edicola! 
E con la prima uscita l'allarme rosso per gli incidenti di rischio biologico. 
Edizioni del Bradipo.
 
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Postato da minopausa, il 14-02-2008 20:25,
4. Le risate, aò!
easgfgbcjzbhafgczbacdc!!!! 
Gruthelsud è micidiale! In perfetto stile short-cut!!! Le risate, aò!
 
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